根据社会福利中心主要职责任务，福利中心设四个内设机构。

一、办公室

负责福利中心综合协调、文秘档案、会议组织、外事外联、接待等行政事务和后勤保障工作。负责中心的人事调配、劳动工资、劳动合同管理、职工福利、人员培训和安全管理。负责党组织建设、党风廉政建设工作。指导“中心”工会、共青团组织、妇女组织开展工作。

二、福利事业发展部

参与老年人福利、儿童福利和救助管理工作政策法规和福利机构标准及管理规范的调研论证。配合做好业务培训和相关管理工作。负责全国社会福利事业网站的建立和管理，通过网络系统为领导决策、公众咨询、行业管理提供信息服务。承担对全国有示范作用的社会福利机构的筹建管理工作。承担境内外福利事业合作项目的开发工作。

三、培训接待部

承担全国各级社会福利机构、救助管理部门人员培训的接待工作，为部机关、直属事业单位、部属社团的各类会议、国内外交流、合作、培训提供接待和服务，为全国民政系统出差来京人员提供食宿、交通服务。对受机关服务中心、减灾中心委托管理资产进行经营和管理。为大厦内事业单位、承租单位提供物业服务并搞好经营创收活动。

四、财务部